Подземные сооружения имеют ряд преимуществ с точки зрения условий хранения складируемых в них объектов и продукции. Например, условия хранения продуктов питания улучшаются благодаря умеренному и постоянному тепловому режиму под землей, а также возможности поддержания герметичности.
Небольшие слои почвы очень эффективно защищают от воздействия шумов, распространяемых по воздуху. Сходным образом, в случае, если источник вибраций находится на поверхности земли или вблизи от нее, уровень вибраций быстро угасает с увеличением глубины размещения и расстояния до источника колебаний.
Как и в случае с шумовыми и вибрационными помехами, грунт предоставляет защиту, поглощая удар и энергию колебаний при взрыве.
При взрыве, выпадении радиоактивных осадков или промышленной аварии подземные сооружения могут стать ценными аварийными убежищами, при условии, что они оснащены оборудованием, позволяющим не пропускать или фильтровать загрязненный воздух извне.
На протяжении десятилетий тоннели использовались для проведения научных исследований, в частности, в области физики элементарных частиц. Тоннели специального назначения строились на границе Франции и Швейцарии с середины 70-х годов, как например, Протонный суперсинхротрон (SPS), введенный в эксплуатацию в 1976 году.
Данное устройство установлено в тоннеле с длиной окружности в 7 км.
Позже был построен Большой электрон-позитронный коллайдер (LEP) с длиной окружности 27 км. Он и по сей день остается крупнейшим в мире электрон-позитронным ускорителем.
И наконец, в 2008 г. Большой Адронный Коллайдер, положил начало новой эре открытий на границе высоких энергий. Все эти исследования стали возможны благодаря строительству тоннелей.
Одним из наиболее примечательных примеров такого положительного воздействия является Всемирное семенохранилище Свальбард: банк-семенохранилище на норвежском острове Шпицберген недалеко от города Лонгйир на удаленном полярном архипелаге Свальбард (Шпицберген).
Сооружение было построено для сохранения в подземной пещере широкого спектра посадочного материала со всего мира. Семенохранилище содержит дублирующие, «резервные» образцы семян, хранящихся в банках-семенохранилищах по всему миру, с целью не допустить их утрату или уничтожение в результате возможных локальных или глобальных катастроф.
Для хранения семян требуется поддерживать постоянную температуру на уровне -18°C (0 °F), таким образом подземное хранение в вечной мерзлоте позволяет обеспечить требуемый тепловой режим при высоком значении тепловой инерции.
Даже если холодильные установки выйдут из строя, должно пройти, по крайней мере, несколько недель до того момента, когда температура повысится до −3 °C (30 °F), температуры окружающей горной породы, состоящей в основном из песчаника.