地下结构在保存储藏于其中的物体或产品方面具有诸多优势。例如，由于地下结构内稳定适中的温度条件以及其保持密封环境的能力，食品的保存期得以延长。
少量的土被对于防止空气噪声的传播非常有用。同样地，如果振源在地表或在地表附近，振级会随着地下深度及振源的距离而迅速降低。
与噪声和振动一样，在爆炸时，地面通过吸收振能和震能提供保护。
当发生爆炸，有放射性尘降物时，以及发生工业事故时，地下结构如果具有排除或过滤掉外界被污染空气的能力，则可以当作可贵的临时避难所。
几十年来，地下隧道一直在用于进行科学研究，特别是在粒子物理学领域。在法国和瑞士的边界，自70年代中期开始就已经建设了很多专用隧道，例如1976年启用的超级粒子中步加速器（SPS）。
此设备安装在一个周长为7千米的隧道内。
后来又建造了LEP（大型电子正电子）加速器，其周长为27千米，它目前仍然是迄今为止最大的电子——正电子加速器。
后来，在2008年，大型强子对撞机开启了高能前沿探索的新纪元。所有这些研究都是通过建设隧道实现的。
最能体现这一有益效果的代表性案例就是斯瓦尔巴全球种子库,这是一个安全的种子库，种子库的位置位于遥远的北极斯瓦尔巴（Svalbard）群岛朗伊尔城（Longyearbyen）附近斯匹次卑尔根岛（Spitsbergen）的挪威岛（Norwegian）。
建立该设施是为了保护来自世界各地各种各样的植物种子，将这些种子保存在一座地下洞室内。种子库有重复样本,或“备用”样本，这些备用样本保存在全球的基因库内，以防基因库的种子丢失时，以及在发生大规模区域性或全球性危机时作为种子的避难所而提供保险。
由于种子需要稳定保持在−18°C（0°F）的温度下，在永久性冻土内进行地下存储有助于保持低温，也提供了较大的热惯性。
即使冷却设备失效，温度升至周围岩床−3°C（30°F）的温度也至少需要数周时间。